Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg2O55111 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms