Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdkO55028 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms