Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zmat3O54836 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms