Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Limk2O54785 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms