Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bnc1O35914 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms