Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phox2bO35690 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms