Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NudcO35685 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NudcO35685 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NudcO35685 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NudcO35685 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NudcO35685 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NudcO35685 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NudcO35685 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms