Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx8O35652 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lhx8O35652 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx8O35652 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms