Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema6aO35464 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms