Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xbp1O35426 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xbp1O35426 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms