Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnih1O35372 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnih1O35372 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms