Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kpna4O35343 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms