Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Lrrc23O35125 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc23O35125 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrrc23O35125 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lrrc23O35125 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc23O35125 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms