Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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