Protein–RNA interactions for Protein: O09174

Amacr, Alpha-methylacyl-CoA racemase, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmacrO09174 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmacrO09174 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmacrO09174 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms