Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Casq1O09165 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casq1O09165 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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