Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms