Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Neurod4O09105 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms