Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap23O09044 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap23O09044 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms