Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps1O08983 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms