Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3239L7N2D9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3239L7N2D9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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