Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm6871L7N248 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6871L7N248 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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