Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20939L7N243 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm20939L7N243 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm20939L7N243 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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