Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer2J3QPU5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer2J3QPU5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms