Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms