Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gm5849J3QPE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5849J3QPE5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5849J3QPE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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