Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms