Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim15G3UY57 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim15G3UY57 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms