Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Susd5G3UW60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Susd5G3UW60 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms