Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r85G3UW56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r85G3UW56 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms