Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp9yF8VPU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp9yF8VPU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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