Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17093F6XGJ4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms