Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc6F2Z461 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms