Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms