Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930451I11RikE9Q9R3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms