Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh16f1E9Q9P8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms