Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Urb2E9Q7L1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Urb2E9Q7L1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Urb2E9Q7L1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms