Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pate1E9Q658 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pate1E9Q658 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms