Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17175E9Q528 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms