Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r238E9Q373 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r238E9Q373 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms