Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc171E9Q1U1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc171E9Q1U1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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