Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myo5cE9Q1F5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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