Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms