Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fndc1E9Q043 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms