Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm4450E9Q007 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm4450E9Q007 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms