Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd2E9PZM4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms