Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms