Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms