Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3lE9PWZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms