Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc62E9PVD1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms